1、基于机器学习算法建立了利用肠道微生物预测幼畜腹泻发生的模型，为降低治疗性抗生素的使用提供了新的思路。幼龄反刍动物的培育是成年牛羊健康和产品安全的基石，犊牛、羔羊高发病率和死亡率是国内外产业发展的关键制约因素。大量研究表明，肠道微生物的组成对于幼畜健康具有重要意义。以犊牛为模型动物，利用“随机森林”方法（人工智能计算技术），从肠道中成功筛选出6种微生物，包括Dorea、Streptococcus、Erysipelatoclostridium、Ruminococcus 2、uncultured Lachnospiraceae和Trueperella，用以提前预测幼畜腹泻发生的可能性，模型准确率可达80%以上，为采取营养调控的手段调控肠道微生物，达到降低或抑制腹泻发生率提供了有效的技术手段，减少养殖中抗生素使用的可能性（ISME Journal，2020）。

 2、揭示了天然植物提取物白藜芦醇调控肉羊甲烷排放量的微生物机制，为养殖业低碳减排提供了技术方法。我国反刍家畜每年排放甲烷约8000万t，而甲烷的温室效应是同体积二氧化碳的25倍，在导致气候变化中具有不可忽视的作用。传统的甲烷排放调控剂包括莫能菌素等抗生素，植物提取物成为近年来甲烷调控研究的热点，与莫能菌素相比，瘤胃微生物对植物提取物产生的抗药性更低，且使用后的动物产品中基本无残留。采用产气法和16sRNA技术研究了白藜芦醇（一种植物多酚提取物）在高精料和高粗料日粮下肉羊瘤胃中的作用，结果表明，白藜芦醇可能通过抑制瘤胃中主要的产甲烷古细菌——甲烷短杆菌属（Methanobrevibacter）的生长，降低了瘤胃甲烷的生成，且而在高粗料条件下作用效果更明显，甲烷产量可降低52%（Microbial Biotechnology，2020）。上述研究为合理通过植物提取物调控瘤胃发酵和甲烷排放提供依据。

3、提出了我国肉用绵羊蛋白质、能量等关键营养需要素参数，为肉羊营养需要量标准的制定提供了依据。2020年我国肉羊存栏量超过3亿只、羊肉产量约500万吨，是世界第一养羊大国，但农区及牧区养殖存在着育肥周期长、效率低等问题，严重制约了我国肉羊产业的发展。究其原因缺乏符合中国国情的的肉羊饲养标准。简单挪用国外饲养标准会因肉羊品种、饲料种类和饲养管理模式上的差异导致饲料资源浪费。采用经典的比较屠宰法，系统开展了我国具有代表性的肉羊育肥期蛋白质、能量、矿物元素等营养素需要量研究，建立了营养参数的数学预测模型。基于该需要量标准，饲养肉羊的生长性能优于使用美国、英国饲养标准中推荐参数的肉羊，该标准的推广应用可提高我国肉羊育肥的生产效率，促进产业节本增效（Animal Nutrition，2019）。

1. Linking perturbations to temporal changes in diversity, stability, and compositions of neonatal calf gut microbiota: prediction of diarrhea. Ma T, et al. ISME Journal, 2020, 14: 2223-2235.

2. Resveratrol affects in vitro rumen fermentation, methane production and prokaryotic community composition in a time- and diet-specific manner. Ma T, et al. Microbial Biotechnology, 2020, 13: 1118-1131.

3. Altered mucosa-associated microbiota in the ileum and colon of neonatal calves in response to delayed first colostrum feeding. Ma T, et al. Journal of Dairy Science, 2019, 102: 7073-7086.

4. Growth performance, nutrient digestibility, and slaughter traits of male fattening lambs under different feeding standards. Ma T, et al. Animal Nutrition, 2019, 5: 74-79.

5. Dissect the mode of action of probiotics in affecting host-microbial T interactions and immunity in food producing animals. Ma T, et al. Veterinary Immunology and Immunopathology, 2018, 205: 35-48.

6. Net protein and metabolizable protein requirements for maintenance and growth of early-weaned Dorper crossbred male lambs. Ma T, et al. Journal of Animal Science and Biotechnology, 2017, 8:40.

7. Effect of protein restriction followed by realimentation on growth, nutrient digestibility, ruminal parameters, and transporter gene expression in lambs. Ma T, et al. Animal Feed Science and Technology, 2017, 231:19-28.

8. Dietary supplementation with mulberry leaf flavonoids inhibits methanogenesis in sheep. Animal Science Journal, 2017, 88:72-78.

9. Effect of supplementation of allicin on methanogenesis and ruminal microbial flora in Dorper crossbred ewes. Journal of Animal Science and Biotechnology, 2016, 7:1.

10. Energy requirements of early-weaned Dorper cross-bred female lambs. Journal of Animal Physiology and Animal Nutrition, 2016, 100: 1081-1089.