被推荐人一直从事奶牛营养基因组学研究，近5年，通过构建奶牛营养多组学研究方案，在奶牛乳蛋白形成相关的生理代谢和微生物机制、粗饲料质量影响奶牛乳蛋白差异的系统生物学机制等方面开展了一系列应用基础研究，取得了较好进展。

1、综合运用多种组学技术，构建了奶牛营养多组学系统研究方案

随着新技术不断发展和学科交叉融合加强，多种组学技术逐渐应用于动物营养研究中，营养基因组学在奶牛研究中起步较晚，相关测定分析方法的系统化至关重要。

被推荐人通过系统探索多组学技术尤其是代谢组学、转录组学和微生物组学在奶牛营养研究中的应用，解析了相关分子元件在奶牛中的分布规律和表达特征，在Scientific Data、Genomics等刊物发表论文4篇，对奶牛营养多组学研究具有重要意义。被推荐人首次提出饲料组学(Feedomics)概念并展望了其在奶牛研究中的应用，在TrAC-Trends in Analytical Chemistry等刊物发表论文3篇，Feedomics被列为Nutrients杂志专刊的四大主题之一，开展的相关研究拓展了动物营养与饲料科学研究范围和深度。

2、系统解析了奶牛乳蛋白形成相关的生理代谢和微生物机制

提高奶牛乳蛋白产量(即牛奶产量、质量双提升)是实现奶业优质高效发展和满足奶制品需求的关键，影响奶牛乳蛋白形成的因素众多，其背后复杂的生物学机制不甚明了。被推荐人系统解析了奶牛乳蛋白形成相关的生理代谢和微生物机制。从生理、代谢和表观遗传方面进行了初探，在Bioinformatics、Journal of Proteomics、Journal of Dairy Science等刊物发表论文6篇;并从微生物角度深入解析，率先提出影响乳蛋白产量的瘤胃微生物贡献度，较好揭示了影响奶牛乳蛋白产量的瘤胃微生物组成和功能机制，在Microbiome、Applied and Environmental Microbiology等刊物发表论文4篇，相关内容在2020年第五届农业生态前沿青年论坛上作了专题报告。这些开创性的成果丰富和发展了奶牛乳蛋白形成相关的生物学机制，为将来通过调控瘤胃微生物改善乳蛋白产量具有重要价值。

3、揭示了粗饲料质量影响奶牛乳蛋白差异的系统生物学机制

我国优质粗饲料资源严重短缺，有效利用非常规饲料是提升我国奶业竞争力的重要举措。被推荐人首次利用多组学技术研究不同质量粗饲料影响奶牛体液和各器官的系统生物学机制，并提出有效营养调控策略，在Bioinformatics、Journal of Animal Science and Biotechnology等刊物发表论文9篇，被国际代谢组学领军人物David Wishart‬教授以及瘤胃微生物顶级专家Sharon Huws教授综述引用，指出了相关工作在解析日粮影响代谢及微生物机制中的重要作用。作为主要内容，被推荐人获批2017年度“博士后国际交流计划”派出项目，在第四届中国畜牧兽医学会动物营养学分会青年学者论坛报告并获优胜奖。该部分成果揭示了秸秆饲料引起奶牛乳蛋白产量低下的关键原因和营养调控策略，为利用作物副产品生产优质牛奶提供了重要的基础知识和实践应用启示。‬

1、Sun, Hui-Zeng; Zhou, Mi; Wang, Ou; Chen, Yanhong; Liu, Jian-Xin*; Guan, Le Luo*; Multi-omics reveals functional genomic and metabolic mechanisms of milk production and quality in dairy cows, Bioinformatics, 2020, 36(8): 2530-2537.

2、Sun, Hui-Zeng; Zhao, Ke; Zhou, Mi; Chen, Yanhong; Guan, Le Luo*; Landscape of multi-tissue global gene expression reveals the regulatory signatures of feed efficiency in beef cattle, Bioinformatics, 2019, 35(10): 1712-1719.

3、Sun, Hui-Zeng; Guan, LeLuo*; Feedomics: Promises for food security with sustainable food animal production, TrAC-Trends in Analytical Chemistry, 2018, 107: 130-141.

4、Sun, Hui-Zeng; Zhu, Zhi; Zhou, Mi; Wang, Jian; Dugan, Michael ER; Guan, Le Luo*; Gene co-expression and alternative splicing analysis of key metabolic tissues to unravel the regulatory signatures of fatty acid composition in cattle, RNA Biology, 2020, 1-9.

5、Sun, Hui-Zeng; Srithayakumar, Vythegi; Jiminez, Janelle; Jin, Weiwu; Hosseini, Afshin; Raszek, Mikolaj; Orsel, Karin; Guan, Le Luo*; Plastow, Graham*; Longitudinal blood transcriptomic analysis to identify molecular regulatory patterns of bovine respiratory disease in beef cattle, Genomics, 2020, 112(6): 3968-3977.

6、Sun, Hui-Zeng#*; Xue, Ming-Yuan#; Guan, Le Luo; Liu, Jian-Xin; A collection of rumen bacteriome data from 334 mid-lactation dairy cows, Scientific Data, 2019, 6: 180301.

7、Sun, Hui-Zeng; Plastow, Graham; Guan, Le Luo*; Advances and challenges in application of feedomics to improve dairy cow production and health, Journal of Dairy Science, 2019, 102(7): 5853-5870.

8、Sun, Hui-Zeng; Shi, Kai; Wu, XueHui; Xue, Mingyuan; Wei, ZiHai; Liu,Jian-Xin; Liu, Hong-Yun*; Lactation-related metabolic mechanism investigated based on mammary gland metabolomics and 4 biofluids' metabolomics relationships in dairy cows, BMC Genomics, 2017, 18(1): 936.

9、Sun, Hui-Zeng; Wang, Bing; Wang, Jia-Kun; Liu, Hong-Yun; Liu, Jian-Xin*; Biomarker and pathway analyses of urine metabolomics in dairy cows when corn stover replaces alfalfa hay, Journal of Animal Science and Biotechnology, 2016, 7(1): 49.

10、Sun, Hui-Zeng; Wang, Di-Ming; Wang, Bing; Wang, Jia-Kun*; Liu, Hong-Yun; Guan, Le Luo; Liu, Jian-Xin*; Metabolomics of four biofluids from dairy cows: potential biomarkers for milk production and quality, Journal of Proteome Research, 2015, 14(2): 1287-1298.